Leczenie zatok można przeprowadzać na kilka możliwości. W pierwsze kolejności stosuje się domowe sposoby.
O ile te nie skutkują sięga się po preparaty z apteki. Te mogą ażeby c tabletkami na zatoki. Używa się też gorące napoje, które posiadają sprzyjać eliminowaniu objawów chorych zatok. W ostatnim czasie w aptekach pojawiły się też preparaty, które umożliwiają płukanie zatok. Preparaty te zwykle zamieszczone są w specjalnych pojemnikach, które irygację zatok umożliwiają. Maja one przyczyniać się do ichniejszym oczyszczania, a co za tym idzie przyspieszać ichniejszym leczenie.
Jeśli chodzi leczenie zatok, to w znaczącej liczbie przypadków odbywa się ono po konsultacji z lekarzem. On na bazie stopni rozbudowania choroby zatok, dobiera odpowiednie leki. W wielu przypadkach zleca płukanie zatok, niemniej jednak nie środkami aptecznymi. Jest to płukanie, które organizuje lekarza. Posiada ono na celu oczyszczenie zatok z wydzieliny i tym samym poprawienie ichniejszym działania. Takie zabiegi najczęściej proponuje się tym chorym, którzy na zatoki chorują przewlekle i co jakiś czas borykają się z tą dolegliwością. Jeżeli już płukanie zatok nie przyniesie szczególnej poprawy, to w wielu przypadkach leczy się zatoki operacyjne. Takie zabiegi jednak poprzedzają masowe badania. Nie można się bowiem jemu poddać, jeżeli już nie spełni się określonych warunków. Operacyjne leczenie zatok jest rozwiązaniem ostatecznym i decydują się na nie jedynie te osoby, które z zapaleniami zatok nie mogą sobie już poradzić, i które chcą się uwolnić od tej dolegliwości. Dlatego rozwiązania takie proponuje się nielicznym pacjentom.